先期设置综合管理部、财务资产部、规划发展部、投资建设部、科技管理部、党群工作部等部门，后期根据发展需要适时设置其他部门；依据理事会所确定的科研方向和技术能力建设方案，适时设立系统研究所，开展技术研究工作。
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